结直肠癌是临床上常见的恶性肿瘤,发病率占恶性肿瘤的10%~15%,死亡率居恶性肿瘤的第3位[1,2]。临床上,大部分患者就诊时已属于结直肠癌晚期,因此化疗在结直肠癌的治疗中占有重要地位[3,4]。以奥沙利铂(oxaliplatin,L-OHP)为代表的铂类药物联合化疗被认为是结直肠癌的标准化疗方案[5]。然而实践中发现,该方案的总体治疗效果并不理想,究其原因在于包括针对L-OHP在内的多药耐药(multidrug resistance,MDR)的产生[6]。在之前的研究中我们发现,miR-145能够降低结直肠癌细胞株HCT116的L-OHP耐药性,并且抑制多药耐药基因1(multidrug resistance 1,MDR1)以及其目的蛋白P-糖蛋白(P-glycoprotein,P-gp)和多药耐药蛋白1(multidrug-resistance protein 1,MRP1)的表达,并促进抑癌基因第10号染色体同源缺失性磷酸酶-张力蛋白基因(phosphatase and tensin homolog deleted on chromosome ten,PTEN)的表达(P < 0.05)[7];然而miR-145究竟是通过何种机制抑制HCT116的L-OHP耐药性尚未有相关报道。本文在上述研究基础上,通过生物信息学预测、鉴定miR-145的靶基因G蛋白偶联受体98(G protein coupled receptor 98,GPR98)并研究其作用,旨在为明确miR-145对人结直肠癌细胞株HCT116耐L-OHP耐药性的作用机制提供依据。
结直肠癌细胞株HCT116购自中国微生物菌种资源库,胰蛋白酶、双抗、RPMI-1640,DMEM和胎牛血清购自美国HyClone公司,L-OHP购自江苏恒瑞医药有限公司,耐药细胞株HCT116/L-OHP、miR-145的模拟体miRNA-mimics及阴性对照NC-miRNA均为本实验前期建立,TRIzol® Reagent和LipofectamineTM 2000脂质体购自美国Invitrogen公司,荧光素酶报告质粒pGL6和过表达质粒pCMV购自上海碧云天生物技术有限公司,Dual-Luciferase Reporter Assay System试剂盒购自美国Promega公司,CCK-8检测试剂盒购自日本同仁化学研究所,反转录试剂盒和SYBR® Fast qPCR Mix定量PCR试剂盒购自大连宝生物工程有限公司,RIPA裂解液和牛血清白蛋白购自美国Sigma公司,兔抗P-gp(ab129450)抗体购自美国Abcam公司,兔抗PTEN(PA5-15540)和抗MRP1(PA5-30594)抗体,山羊抗兔二抗(65-6120)均购自美国ThermoFisher公司,PVDF膜购自美国Millipore公司,ECL试剂盒购自美国Amersham公司,引物由上海生工生物公司合成。
结直肠癌细胞株HCT116培养在含有10%胎牛血清的RPMI-1640培养液中,添加1%双抗,放置在37℃含有5% CO2的培养箱中;每隔3 d用0.25%胰蛋白酶消化后传代培养。耐药细胞株HCT116/L-OHP由本实验前期建立,采用药物浓度递增和间歇诱导的方法获得,同样培养在含有10%胎牛血清的RPMI-1640培养液中,在后续实验进行的前1周停止L-OHP诱导[7]。后续实验使用的HCT116和HCT116/L-OHP细胞株均是处于对数生长期的第2代细胞(经1次传代)。人胚肾细胞HEK-293T使用含有10%胎牛血清的DMEM培养液,放置在5% CO2的37℃恒温培养箱中。
通过CCK-8法检测,将细胞用0.25%胰蛋白酶消化后重悬,调整细胞浓度,以2 × 104个细胞·100 μl-1·孔-1的密度接种于96孔板。测定细胞对L-OHP敏感性实验:分别加入不同浓度的L-OHP(0、6.25、12.50、25.00、50.00和100.00 μg/ml)处理72 h,每个浓度设置3个重复孔;随后每孔加入10 μl CCK-8溶液,在培养箱中孵育2 h后,测定每孔在450 nm处的吸光值(A)。以L-OHP浓度为横坐标,细胞生长抑制率作为纵坐标,绘制量效曲线,抑制率=(1-AHCT116/L-OHP/AHCT116)×100%,通过线性回归计算得到纵坐标为50%时对应的横坐标数值,即为被测拮抗剂的半抑制浓度(IC50)。IC50越低,代表对药物的敏感性越强。对于不用L-OHP处理的细胞,分别测量各组在450 nm处的A值,以A450值为纵坐标绘制曲线,检测细胞的增殖能力。
将常规培养的HCT116/L-OHP细胞经0.25%胰蛋白酶消化后,以1 × 105个细胞/孔的密度接种在6孔板中,常规培养24 h后随机分为3组:HCT116/L-OHPmimics(过表达miR-145组,每孔加入0.2 μg miRNA-mimics),HCT116/L-OHPNC(阴性对照,每孔加入0.2 μg NC-miRNA)和HCT116/L-OHP(空白对照),经LipofectamineTM2000介导转染48 h后,检测miR-145的表达以验证转染效果。
通过TargetScan (http://www.targetscan.org/)和microRNA.org(http://www.microrna.org/microrna/home.do/)预测miR-145潜在的靶基因;通过RNAhybrid(http://bibiserv. techfak.uni-bielefeld.de/rnahybrid/)预测miR-145在靶基因mRNA 3′-非翻译区(3′-untranslated regions,3′-UTR)的结合序列;根据已有的实验结果和文献报道筛选靶基因,并在图中展示结合序列,初步筛选GPR98为本实验的靶基因。
分离、纯化并扩增包含miR-145结合序列的靶基因GPR98 cDNA片段后,与荧光素酶报告质粒pGL6连接(pGL6-GPR98);同时,替换GPR98 cDNA片段中miR-145结合序列的部分碱基,与pGL6连接形成突变质粒(pGL6-mutGPR98)。将pGL6-GPR98和pGL6-mutGPR98分别与miRNA-mimics和NC-miRNA用LipofectamineTM 2000脂质体共转染入人胚肾细胞HEK-293T,孵育48 h后,用Dual-Luciferase Reporter Assay System试剂盒检测GPR98的荧光强度,验证miR-145和GPR98之间的靶向关系。
分离,纯化并扩增GPR98的基因片段,与pCMV连接(pCMV-GPR98),空质粒载体pCMV-vector作为阴性对照。将pCMV-GPR98和pCMV-vector用LipofectamineTM2000分别转染入HCT116/L-OHP细胞,孵育48 h,并以400 μg/ml的G418筛选稳定过表达GPR98的细胞HCT116/L-OHPGPR98和空载体细胞HCT116/L-OHPcontrol,检测GPR98的表达以验证转染效果;此外,将不包含miR-145结合序列的突变质粒pCMV-mutGPR98与miRNA-mimics共转染入HCT116/L-OHP细胞,构建过表达miR-145和GPR98的HCT116/L-OHPmimics+GPR98细胞,并以过表达miR-145的HCT116/L-OHPmimics细胞作为对照。
弃掉培养液加入TRIzol®Reagent后反复吹打细胞,收集细胞溶液用异丙醇法提取细胞的总RNA。应用Nanodrop分光光度计进行RNA定量检测,逆转录试剂盒将RNA反转录为cDNA。使用SYBR®Fast qPCR Mix试剂盒进行定量PCR检测,miR-145上游引物序列为5′-CTCACGGTCCAGTTTTCCCA-3′,下游引物序列为5′-ACCTCAAGAACAGTATTTCCAGG-3′;以U6核内小RNA作为内参基因:上游引物序列为5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′,下游引物序列为5′-AACGCTTCACGAAYYYGCGT-3′。GPR98上游引物序列为5′-GGGATGCCCTCTGCATCTTT-3′,下游引物序列为5′-TCACCAGCGTCCTCTCCATA-3′;以β-actin作为内参基因:上游引物序列为5′-CCTCGCCTTTGCCGATCC-3′,下游引物序列为5′-GGCCATCTCTTGCTCGAAGT-3′。反应条件为95℃ 2 min预变性,95℃ 10 s,55 °C 40 s,72℃ 1 min,共做40个循环。每组实验设置3个平行孔,用2-△△Ct法计算mRNA的相对表达量。
弃掉培养液每孔加入1 ml RIPA裂解液在冰上轻轻摇晃10 min,随后反复吹打并收集细胞裂解液,用Bradford方法测定蛋白浓度。取10 μg蛋白经聚丙烯酰胺凝胶电泳,电转至PVDF膜上,随后在4℃条件下用10%牛血清白蛋白封闭过夜处理。在室温下PVDF膜再经一抗孵育,洗膜,二抗孵育,洗膜等过程,用ECL发光试剂盒检测目的蛋白的表达。以β-actin作为内参蛋白,条带的定量分析使用Image-Pro Plus 6.0软件。
采用SPSS 19.0软件进行数据的统计分析,计量资料采用±s表示,组间比较采用t检验和单因素方差分析,采用Bonferroni法对单因素方差分析有意义的项目进行两两比较。检验水准α= 0.05,P < 0.05表示差异有统计学意义。
HCT116/L-OHP耐药细胞的IC50为(42.34 ± 1.05)μg/ml,高于HCT116细胞的IC50(9.81 ± 0.95)μg/ml,差异有统计学意义(t= 39.784,P= 0.000),两组细胞抑制率曲线见图1a;此外,HCT116/L-OHP细胞miR-145的相对表达水平为0.27 ± 0.04,低于HCT116细胞(1.00 ± 0.09),差异有统计学意义(t= 13.021,P= 0.000),见图1b。
HCT116/L-OHPmimics中miR-145的相对表达水平为10.01 ± 1.05,高于HCT116/L-OHPNC(1.06 ± 0.14)和HCT116/L-OHP(1.00 ± 0.16),差异有统计学意义(F= 161.797,P= 0.000),见图2。
注:1为HCT116/L-OHP;2为HCT116-OHPNC;3为HCT116/L-OHPmimics
初步筛选GPR98为本实验的靶基因。miR-145在GPR98 mRNA的3′-UTR结合序列如图3所示。荧光素酶检测结果显示,与转染NC-miRNA的阴性对照组(1.91 ± 0.19)比较,过表达miR-145后pGL6-GPR98的荧光强度受到抑制(0.33 ± 0.10),差异有统计学意义(t= 12.880,P= 0.000);而miR-145的过表达并不能影响pGL6-mutGPR98的荧光强度,差异无统计学意义(t= 0.431,P= 0.689),见图3b。
注:1为NC-miRNA;2为MiRNA-mimics
HCT116/L-OHP耐药细胞中GPR98 mRNA和蛋白相对表达水平分别为3.19 ± 0.36和1.48 ± 0.04,与转染NC-miRNA的阴性对照组相近(GPR98 mRNA:3.24 ± 0.36;GPR98蛋白:1.47 ± 0.04),均高于HCT116细胞(GPR98 mRNA:1.00 ± 0.11;GPR98蛋白:1.00 ± 0.09)和过表达miR-145的HCT116/L-OHPmimics细胞(GPR98 mRNA:0.39 ± 0.06;蛋白:0.18 ± 0.03),差异具有统计学意义(mRNA:F=93.923,P= 0.000;蛋白:F= 150.405,P= 0.000),见图4。
HCT116/L-OHPmimics+GPR98细胞的GPR98 mRNA相对表达水平为8.68 ± 0.70,蛋白相对表达水平为1.68 ± 0.13;HCT116/L-OHPGPR98细胞的GPR98 mRNA相对表达水平为8.48 ± 0.46,蛋白相对表达水平为1.71 ± 0.09。两组细胞的GPR98mRNA和蛋白表达水平均高于HCT116/L-OHPcontrol(GPR98 mRNA:3.65 ± 0.40;GPR98蛋白:1.21 ± 0.10)和HCT116/L-OHP(GPR98 mRNA:3.49 ± 0.35;GPR98蛋白:1.22 ± 0.08),差异均具有统计学意义(均P < 0.05),见图5。
过表达GPR98的HCT116/L-OHPGPR98细胞及各组细胞的增殖情况见图6(F= 53.548,P= 0.000)。HCT116/L-OHPGPR98细胞A450值为1.31 ± 0.10,高于HCT116/L-OHP(0.82 ± 0.08),差异具有统计学意义(t= 6.251,P= 0.000);HCT116/L-OHPmimics+GPR98细胞A450值为0.89 ± 0.08,高于HCT116/L-OHPmimics(0.20 ± 0.05),差异具有统计学意义(t= 11.158,P= 0.000)。
HCT116/L-OHPGPR98细胞中耐药蛋白P-gp和MRP1的相对表达水平分别为1.53 ± 0.18和1.49 ± 0.20,高于HCT116/L-OHP细胞(分别为1.00 ± 0.06和1.21±0.13),而HCT116/L-OHPGPR98细胞抑癌蛋白PTEN的相对表达水平为0.12 ± 0.03,低于HCT116/L-OHP细胞(1.25 ± 0.14),差异均有统计学意义(均P < 0.05);HCT116/L-OHPmimics+GPR98细胞P-gp和MRP1的蛋白相对表达水平分别为1.02 ± 0.24和1.38 ± 0.25,高于HCT116/L-OHPmimics(分别为0.20 ± 0.07和0.55 ± 0.10),而HCT116/L-OHPmimics+GPR98PTEN的蛋白相对表达水平为1.41 ± 0.16,低于HCT116/L-OHPmimics(1.98 ± 0.13);差异均有统计学意义(均P < 0.05),见图7。
HCT116/L-OHPGPR98 IC50为(73.54 ± 1.21)μg/ml,约为HCT116/L-OHP IC50[(41.25 ± 1.56)μg/ml]的1.8倍,差异有统计学意义(t= 25.041,P= 0.000);HCT116/L-OHPmimics+GPR98 IC50为(48.80 ± 1.75)μg/ml,约为HCT116/L-OHPmimics IC50[(19.20 ± 0.81)μg/ml]的2.5倍,差异有统计学意义(t= 22.994,P= 0.000)。4组细胞抑制率曲线见图8。
G蛋白偶联受体(G protein coupled receptor,GPR)家族是细胞表面最大的分子族群[8],在信号传导和器官发育中发挥了重要作用[9],许多学者开始关注GPR与肿瘤发生的关系。有研究显示,GPR在肿瘤的发生发展中扮演了重要角色[10],在肿瘤组织和细胞中多高表达[11],其生物学功能包括促进肿瘤细胞的增殖[10]和转移[12]。有学者曾证明GPR49在结直肠癌中的高表达与结直肠癌的发生发展密切相关[13],然而GPR98在结直肠癌中扮演的角色还未见研究与报道。
miRNA在肿瘤的发生和发展中起重要作用。有文献报道,miR-145通过靶向调节RAD18的表达,能够逆转结直肠癌的5-氟尿嘧啶耐药性[14]。我们的前期研究发现,miR-145的高表达可以降低HCT116细胞的L-OHP耐药性[7],然而其机制并不清楚。在本研究中,我们证明GPR98是miR-145的靶基因并受其负调控,并且GPR98在HCT116/L-OHP细胞中高表达;通过建立GPR98和miR-145的联合过表达体系,研究GPR98过表达对HCT116/L-OHP细胞增殖和耐药性的效果,结果证明miR-145通过靶向GPR98调节HCT116/L-OHP细胞的耐药性。
有研究显示,MRP1和P-gp在结直肠癌耐药中发挥着重要作用[15,16]。P-gp蛋白是MDR1基因的目的蛋白,也是药泵蛋白之一,能够将抗癌药物以主动转运方式泵至细胞外,使药物在细胞内难以积累达到有效浓度而产生耐药性[17]。MRP1主要介导细胞内外的物质转运,能够作为转运泵将谷胱甘肽-抗癌药物复合物转运出细胞,从而介导肿瘤细胞的耐药性[18],也是肿瘤细胞出现MDR的原因之一[19]。PTEN是肿瘤抑制基因,其低表达与肿瘤的转移密切相关[20],也有报道证明PTEN是引起耐药性的原因之一[21]。在本研究中,GPR98的过表达显著促进了P-gp和MRP1的表达,抑制了PTEN的表达,并且GPR98的过表达显著增强了细胞的耐药性,提示MRP1与P-gp的表达增加及两者的共表达,以及PTEN表达的降低,是导致结直肠癌的MDR的重要机制。因此,临床上两种或更多耐药基因的综合检测具有重要意义,一方面可揭示肿瘤的耐药机制,回避无效药物制定有效的治疗方案,预测治疗结果;另一方面可阐述肿瘤耐药的原因,针对耐药基因开发针对性的药物,增强治疗效果。此外,经GPR98过表达处理后miR-145过表达产生的效果被部分逆转,说明miR-145很可能是通过调节GPR98影响细胞的耐药性。总之,联合前期的研究成果,我们发现了miR-145调节HCT116/L-OHP细胞耐药性较完整的分子机制,为减轻结直肠癌的耐药性和探索更有效的治疗方法提供了理论依据。
预测鉴定miR-145靶基因,探讨miR-145抑制结直肠癌细胞株HCT116奥沙利铂(L-OHP)耐药性的机制。
在人结直肠癌细胞株HCT116的基础上,建立人结直肠癌L-OHP耐药细胞株HCT116/L-OHP。脂质体转染法将miR-145的模拟体miRNA-mimics及阴性对照NC-miRNA转染入HCT116/L-OHP,得到过表达miR-145的细胞株HCT116/L-OHPmimics及其阴性对照HCT116/L-OHPNC。预测miR-145的靶基因并用荧光素酶方法验证。确定靶基因为G蛋白偶联受体98(GPR98)后,构建质粒并转染细胞,得到过表达GPR98的HCT116/L-OHPGPR98细胞及其对照HCT116/L-OHPcontrol;同时通过更改GPR98 cDNA中与miR-145结合的序列,得到同时过表达GPR98和miR-145的HCT116/L-OHPmimics+GPR98细胞。本研究采用CCK-8法检测细胞的增殖能力[吸光值(A)]值和对L-OHP的敏感性(被测拮抗剂的半抑制浓度IC50越低,代表对药物的敏感性越强)。实时定量PCR检测miR-145和GPR98的mRNA表达水平;western blot法检测GPR98和耐药相关蛋白P-糖蛋白(P-gp)、多药耐药蛋白1(MRP1)以及抑癌基因PTEN的蛋白表达水平。
成功建立耐药细胞株HCT116/L-OHP[IC50:(42.34 ± 1.05)μg/ml,高于HCT116细胞的(9.81 ± 0.95)μg/ml,t= 39.784,P= 0.000;miR-145:0.27±0.04,低于HCT116细胞的1.00 ± 0.09,t= 13.021,P= 0.000]。在HCT116/L-OHP基础上,成功构建HCT116/L-OHPmimics细胞[miR-145:10.01 ± 1.05,高于HCT116/L-OHPNC(1.06 ± 0.14)和HCT116/L-OHP(1.00 ± 0.16),F= 161.797,P= 0.000]。GPR98经鉴定是miR-145的靶基因。HCT116/L-OHPGPR98细胞中GPR98的mRNA和蛋白相对表达分别为8.48 ± 0.46和1.71 ± 0.09,与HCT116/L-OHPcontrol(mRNA:3.65 ± 0.40;蛋白:1.21 ± 0.10)和HCT116/L-OHP(mRNA:3.49 ± 0.35;蛋白:1.22 ± 0.08)比较,差异有统计学意义(均P < 0.05)。HCT116/L-OHPGPR98细胞A450值为1.31 ± 0.10,高于HCT116/L-OHP(0.82±0.08,t=6.251,P=0.000);HCT116/L-OHPmimics+GPR98细胞A450值为0.89 ± 0.08,高于HCT116/L-OHPmimics(0.20 ± 0.05,t= 11.158,P= 0.000)。HCT116/L-OHPGPR98细胞中耐药蛋白P-gp和MRP1的相对表达水平分别为1.53 ± 0.18和1.49 ± 0.20,高于HCT116/L-OHP细胞(分别为1.00 ± 0.06和1.21 ± 0.13),而抑癌蛋白PTEN的相对表达水平为0.12 ± 0.03,低于HCT116/L-OHP细胞(1.25 ± 0.14),差异均有统计学意义(均P < 0.05)。HCT116/L-OHPmimics+GPR98细胞P-gp和MRP1的蛋白相对表达水平分别为1.02 ± 0.24和1.38 ± 0.25,高于HCT116/L-OHPmimics(分别为0.20 ± 0.07和0.55 ± 0.10),而PTEN的蛋白相对表达水平为1.41 ± 0.16,低于HCT116/L-OHPmimics(1.98 ± 0.13),差异均有统计学意义(均P < 0.05)。HCT116/L-OHPGPR98 IC50为(73.54 ± 1.21)μg/ml,高于HCT116/L-OHP的(41.25 ± 1.56)μg/ml(t= 25.041,P= 0.000);HCT116/L-OHPmimics+GPR98 IC50为(48.80 ± 1.75)μg/ml,高于HCT116/L-OHPmimics的(19.20 ± 0.81)μg/ml(t= 22.994,P= 0.000)。
miR-145通过抑制靶基因GPR98的表达水平,从而抑制人结直肠癌细胞株HCT116细胞的L-OHP耐药性。