mA结合蛋白YTHDC2调节p38MAPK信号通路影响结直肠癌细胞凋亡

中华结直肠疾病电子杂志,第12卷第2期 第117页-第124页

张师垚,徐岩岩,张琦,李春强,赵智成,刘刚

  摘要

目的
探讨m6A结合蛋白YTHDC2在结直肠癌发展过程中的分子机制及其所参与的信号通路。
方法
通过The Human Protein Atlas和GEPIA网站分析肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中YTHDC2与结直肠癌的关系,探究相关的信号转导途径和生物学过程。体外培养结直肠癌HCT116和Caco2细胞系,对YTHDC2进行过表达或敲低后,采用RT-PCR和Western blot检测p38MAPK、p-p38MAPK及其下游凋亡相关蛋白在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路中的表达,流式细胞术检测细胞凋亡率。
结果
The Human Protein Atlas和GEPIA分析结果表明,肿瘤组织中YTHDC2表达水平较癌旁组织存在降低趋势,YTHDC2的表达增加与结直肠癌患者总体生存率提高呈正相关。基于cBioPortal和Xena数据库中结直肠癌相关的基因表达量和临床数据以及KEGG和GO数据库中的注释基因集,基因集富集分析(GSEA)提示,YTHDC2具有调控MAPK信号通路的作用。流式细胞术检测结果显示,敲除YTHDC2时细胞凋亡比率显著减少,过表达时则显著增加,Western blot检测结果显示,p38MAPK表达未见显著变化,p-p38MAPK在YTHDC2过表达时显著升高,敲除时显著降低。基因表达谱交互分析(GEPIA)结果提示,凋亡蛋白的表达与YTHDC2的表达呈正相关,与RT-PCR和Western blot检测结果相符合。
结论
YTHDC2激活p38MAPK信号途径中外源性死亡受体和内源性线粒体凋亡通路调控结直肠癌细胞的凋亡。

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